Le système endocrinien intervient avec le système immunitaire dans la fonction de maintien et d'intégrité de l'organisme. Il assure la régulation des organes, accélère et ralentit leur fonctionnement.

Ce système se compose des glandes endocrines qui produisent des hormones (protéine sécrétée par une glande endocrine). Il régule l'homéostasie et l'homéothermie.

L'hypothalamus et l'hypophyse régulent une partie de ces glandes endocrines. Les glandes endocrines sont de petite taille, réparties dans l'organisme et richement vascularisées, afin de faciliter le passage des hormones dans le sang.

* L'hypothalamus

- C'est la partie du cerveau qui contrôle les  sécrétions hypophysiaires, la température corporelle, mais aussi la faim, la soif, la libido. Il sécrète des neuro-hormones qui stimulent l'hypophyse, qui libérera à son tour des hormones vers un organe cible.

* L'hypophyse

- Elle se situe à la base du cerveau. Elle stimule toutes les autres glandes endocrines. Elle sécrète l'hormone de croissance ainsi que des hormones qui agissent sur les glandes sexuelles. Elle contrôle la fabrication des hormones thyroïdiennes, des corticosurrénales, de la lactation et de l'hormone antidiurétique régulant l'eau dans l'organisme.